软件架构是非常重要的，它决定了整个软件如何实现其业务架构与数据流程。而复杂业务系统的架构和数据流是非常复杂的，很难短时间学习并理解清楚，所以也很难在短时间内发现其中的安全问题。尽管有困难，但是团队应该尽早进行架构安全分析，明确技术上的安全要求，及早发现架构中的安全风险点，否则由于架构在安全方面设计的先天不足，很可能会在开发出来的应用程序当中埋下安全隐患。因此，在进行架构设计的时候或者在进行开发工作之前，应当对软件架构的安全性进行分析，看其中是否包含潜在的安全问题，尽早将其扼杀在摇篮中。
现如今的应用程序往往涉及到多个模块甚至系统之间的对接，架构师在设计系统架构的时候需要充分考虑各个层面上的安全威胁，比如用户在使用过程中如何保证数据的完整性以避免被黑客篡改，在用户重置密码的时候如何保证重要敏感数据不被盗取，再比如整个软件架构是否能有效应对突发性的大规模访问请求，如何保证服务的可用性，等等。